加强工程项目审计，对于防范审计风险，强化工程项目过程监控，提高资金使用效益，发挥着十分重要的作用。那么，如何做好工程项目审计工作呢？
一、做好资料收集整理
资料是工程项目审计的基础。完整的审计资料，可以全面掌握工程项目建设情况，防范审计风险。工程项目审计资料主要包括项目批准文件、招投标资料、中标通知书、建设合同、图纸、工程量清单、主要材料单价、竣工决算书、项目建设会议记录和相应管理制度等。收集和整理好资料是工程审计最基础的工作。
二、审查工程合同内容
签订工程施工合同是明确甲乙双方权利义务，确保工程项目顺利实施的有效保证措施。所以要重点审查合同条款是否符合招标文件及有关规定；合同价款的确定，调整计价标准的约定是否明确、严谨、合规；重大隐蔽工程、重大变更事项的施工监督的约定是否有明确约定等相关内容。
三、做好现场踏勘记录
加强对现场的实地测量、重点抽查，深入现场，采取测量、挖钻、取样、拍照等方式获取第一手资料，以深入了解和掌握工程建设的实际情况、实际施工记录、工程签证尤其是隐蔽签证、设计变更、材料价格等关键资料和数据。
四、强化项目搜集调查
一是要集中听取被审计单位及其它有关部门对被审计对象做出的情况介绍，做到心中有数；二是要根据搜集到的有关审计资料，结合实地踏勘项目建设现场，掌握总体情况；三是要根据掌握的情况和搜集到的资料，对涉及到的单位进行延伸走访；四是要根据听到的、看到的情况和资料，结合项目审计的总体情况，及时进行讨论审议，为审计实施打下坚实基础。
五、检查工程取费标准
审计施工企业在取费时是否提高了取费档次提取相关费用，审计建筑工程取费计算过程。重点是审计各项费用在计算时所确定的基数是否符合地方的文件规定，取费是否与工程类别一致，费用内容有无重复计算等问题。